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基于DGGE技术的茯砖茶发花过程细菌群变化分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
刘石泉;胡治远;赵运林
通讯作者:
Zhao, Y.
作者机构:
[刘石泉] 湖南农业大学生物科学与技术学院
[胡治远; 赵运林] 湖南城市学院化学与环境工程学院
通讯机构:
College of Chemistry and Environmental Engineering, Hunan City University, China
语种:
中文
关键词:
茯砖茶;发花发酵;变性梯度凝胶电泳(DGGE);细菌群
关键词(英文):
Bacterial flora;Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE);Fahua-fermentation;Fuzhuan brick tea
期刊:
生态学报
ISSN:
1000-0933
年:
2014
卷:
34
期:
11
页码:
3007-3015
基金类别:
湖南省自然科学基金项目(13JJ6074) 湖南省高校产学研合作示范基地产业化项目(13CY025,11CY003,11CY004) 湖南省科学技术厅科技计划国际合作项目(2012WK2013) 益阳市科学技术局科技计划项目([2013]YK1323)
机构署名:
本校为通讯机构
院系归属:
材料与化学工程学院
摘要:
变性梯度胶电泳是当前微生物生态学研究重要技术之一。为研究茯砖茶发花过程中细菌群落结构和种类,对发花过程中不同时段细菌16S rDNA的V3可变区扩增,经变性梯度胶电泳(DGGE)后、对细菌DGGE条带进行克隆、测序和比对。结果表明,在发花过程的第0—4天、6—8天、10—14天茯砖茶发花存在3个差异较大的细菌优势种群结构的演变;从16SrDNA的V3可变区比对结果证明黑毛茶发花过程中有短波单胞菌属、诺卡氏菌属、新鞘脂菌属、突那梭菌属、韦龙氏假单胞菌属、乳杆菌属、克雷伯氏菌属以及不可培养ε-变形菌、腐败螺旋菌属、粘球菌属、根瘤菌属和6种未知分类地位的不可培养细菌,说明采用DGGE指纹图谱能更系统...
摘要(英文):
Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) is one of the most important and commonly used techniques in studies of microbial molecular ecology. DGGE has been widely used in the analysis of community structures and biodiversity of bacteria, cyanobacteria, archaea, miniature eukaryotes, eukaryotes, and viruses. This technique can be used for the reliable analysis of multiple samples at the same time. It is suitable for the surveillance of microbial population changes over both space and time, and is used to probe microbial community compositi...

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